Wariant ASGR1 związany ze zmniejszonym ryzykiem choroby niedokrwiennej serca cd

Wśród próbek z przypisanymi genotypami, 119, 146 uzyskało informacje o poziomach cholesterolu nie-HDL w surowicy (tabela S1 w dodatkowym dodatku). Niektóre analizy, które przeprowadziliśmy na tych danych, opisano wcześniej.15,16 Zidentyfikowaliśmy zestaw siedmiu skorelowanych niekodujących polimorfizmów pojedynczego nukleotydu (SNP) na chromosomie 17p13.1 (parami r2> 0.70), które mają związek z nie-HDL poziomy cholesterolu. Siedem wariantów obejmuje 80 kb, w tym ASGR1 i ASGR2, które kodują podjednostki receptora asialoglikoproteinowego. Najsilniejsze skojarzenie zaobserwowano dla mniejszego allelu rs186021206 zlokalizowanego 7,3 kb w dół od ASGR1 (częstość mniejszych alleli, 0,43%). Ten allel wiąże się z obniżeniem cholesterolu nie-HDL o 12,9 mg na decylitr (95% przedział ufności [CI], 8,7 do 17,1 [0,33 mmol na litr, 95% CI, 0,22 do 0,44]; P = 1,4 x 10- 9) (tabela S3 w dodatkowym dodatku). Chociaż ten siedmiokrotny region SNP był dobrze pokryty odczytami uzyskanymi na sekwencjonowaniu całego genomu, uzyskaliśmy małe pokrycie intronu 4 ASGR1, który jest wzbogacony w guanozynę (G) i reszty cytozyny (C), a zatem trudny do sekwencjonowania. W ten sposób zsekwencjonowaliśmy całe genomy 738 uczestników za pomocą metody wolnej od PCR, która jest lepiej dostosowana do otrzymywania sekwencji bogatych w GC traktatów i obserwowała del2 w intronie 4 (sekwencja referencyjna NCBI, NM_001671.4; c.284-36_283 + 33delCTGGGGCTGGGG).
Tabela 1. Tabela 1. Związek del12 z lipidami, fosfatazą alkaliczną i witaminą B12 w Islandii, Danii i Holandii. Po bezpośrednim genotypowaniu del12 u 3799 Islandczyków i imputacji u 398,000 Islandczyków zaobserwowaliśmy, że del12 (częstość mniejszych alleli, 0,41%, odpowiadające częstotliwości na 120 nosicieli heterozygotycznych) było silnie skorelowane z rs186021206 (r2 = 0,86) i pozostałymi sześcioma silnie związanymi SNP (tabele S3 i S4 w dodatkowym dodatku). Ponadto del12 był silniej związany z niższym poziomem cholesterolu nie-HDL niż którykolwiek z siedmiu SNP, z poziomem, który był niższy wśród heterozygotycznych nosicieli del12 niż wśród nie-nośników o 13,6 mg na decylitr (95% CI, 9,4 do 17,7 [ 0,35 mmol na litr, 95% CI, 0,24 do 0,46], P = 2,5 x 10 10) (Tabela i Tabele S3 i S4 i Rys. Wariant del12 był także związany z niższymi poziomami cholesterolu LDL, z wielkością efektu podobną do obserwowanej pomiędzy poziomami cholesterolu del12 i nie-HDL.
Przeprowadziliśmy replikację wcześniej zgłoszonego związku pomiędzy wspólnym wariantem powyżej ASGR1 (rs314253, częstość mniejszych alleli, 35,1%) i obniżeniem poziomów cholesterolu LDL17; jednak to powiązanie było niezależne od sygnału del12 (r2 <0,001) (tabela S5 w dodatkowym dodatku). Po skorygowaniu pod względem obecności del12, ani rs186021206, ani żaden z pozostałych sześciu SNP pozostały w znacznym stopniu związane z poziomem cholesterolu nie-HDL (Tabela
Analiza rozszerzonego zbioru danych islandzkich z 5817 dodatkowymi sekwencjami genomowymi, które zapewniały zwiększone pokrycie sekwencji, wskazała, że ze wszystkich wariantów w obrębie 1-mega regionu skupionego na ASGR1, del12 wykazywał najsilniejsze powiązanie z poziomami nie-HDL (Fig.
[patrz też: Gabinet Stomatologiczny, implanty zielona góra, program stomatologiczny ]

Powiązane tematy z artykułem: Gabinet Stomatologiczny implanty zielona góra program stomatologiczny