Wariant ASGR1 związany ze zmniejszonym ryzykiem choroby niedokrwiennej serca cd

Wśród próbek z przypisanymi genotypami, 119, 146 uzyskało informacje o poziomach cholesterolu nie-HDL w surowicy (tabela S1 w dodatkowym dodatku). Niektóre analizy, które przeprowadziliśmy na tych danych, opisano wcześniej.15,16 Zidentyfikowaliśmy zestaw siedmiu skorelowanych niekodujących polimorfizmów pojedynczego nukleotydu (SNP) na chromosomie 17p13.1 (parami r2> 0.70), które mają związek z nie-HDL poziomy cholesterolu. Siedem wariantów obejmuje 80 kb, w tym ASGR1 i ASGR2, które kodują podjednostki receptora asialoglikoproteinowego. Najsilniejsze skojarzenie zaobserwowano dla mniejszego allelu rs186021206 zlokalizowanego 7,3 kb w dół od ASGR1 (częstość mniejszych alleli, 0,43%). Ten allel wiąże się z obniżeniem cholesterolu nie-HDL o 12,9 mg na decylitr (95% przedział ufności [CI], 8,7 do 17,1 [0,33 mmol na litr, 95% CI, 0,22 do 0,44]; P = 1,4 x 10- 9) (tabela S3 w dodatkowym dodatku). Chociaż ten siedmiokrotny region SNP był dobrze pokryty odczytami uzyskanymi na sekwencjonowaniu całego genomu, uzyskaliśmy małe pokrycie intronu 4 ASGR1, który jest wzbogacony w guanozynę (G) i reszty cytozyny (C), a zatem trudny do sekwencjonowania. W ten sposób zsekwencjonowaliśmy całe genomy 738 uczestników za pomocą metody wolnej od PCR, która jest lepiej dostosowana do otrzymywania sekwencji bogatych w GC traktatów i obserwowała del2 w intronie 4 (sekwencja referencyjna NCBI, NM_001671.4; c.284-36_283 + 33delCTGGGGCTGGGG). Continue reading “Wariant ASGR1 związany ze zmniejszonym ryzykiem choroby niedokrwiennej serca cd”

Wariant ASGR1 związany ze zmniejszonym ryzykiem choroby niedokrwiennej serca ad

Szczegółowe informacje dotyczące 10 zestawów próbek kontrolujących przypadki znajdują się w sekcji Metody i w tabeli S2 w dodatkowym dodatku. Generowanie i analiza danych
Użyliśmy mikromacierzy Illumina do genotypowania islandzkich próbek, jak opisano wcześniej.11 Sekwencjonowaliśmy genomy 2636 Islandczyków przy użyciu standardowych metod TruSeq (Illumina) do średniej głębokości co najmniej 10 × (mediana, 20 ×), analizy, która również opisano wcześniej11 i opisano w sekcji Metody w dodatkowym dodatku. Wygenerowaliśmy dane sekwencyjne od 738 Islandczyków, stosując metodę wolnej od łańcuchów reakcji polimerazy TruSeq (PCR) (Illumina, średnia głębokość, 30 x) w celu polepszenia pokrycia bogatą w GC sekwencję intronu 4 w ASGR1, która koduje podjednostkę receptor asialoglikoproteinowy.
Aby uzyskać wiarygodne przypisanie wariantu z niekodującą delecją 12-par zasad (delp) (del12), która nie jest łatwo wywoływana z danych dotyczących sekwencji całego genomu, genotypowaliśmy próbki uzyskane od 3799 Islandczyków i wykorzystaliśmy te genotypy jako trening zestaw do przypisania del12 pozostałym mieszkańcom Islandii. Informacja o imputacji dla del12 wynosiła 0,99. (Szczegóły dotyczące imputacji genotypu znajdują się w sekcji Metody w dodatkowym dodatku.) W przypadku drugiego wariantu utraty funkcji, p.W158X, przeprowadziliśmy sekwencjonowanie Sangena na próbkach pobranych od 345 uczestników, w tym 79 przewoźników i 270 nieobciążających wariant p.W158X i wykorzystał genotypy do ulepszenia imputacji wariantu w islandzkim zbiorze danych. Informacja o imputacji dla p.W158X wynosiła 1,00. Continue reading “Wariant ASGR1 związany ze zmniejszonym ryzykiem choroby niedokrwiennej serca ad”

Wariant ASGR1 związany ze zmniejszonym ryzykiem choroby niedokrwiennej serca

Wiadomo, że kilka wariantów sekwencji wpływa na poziomy cholesterolu lipoprotein o niskiej gęstości (HDL) w surowicy, które zmieniają ryzyko choroby wieńcowej. Metody
Zsekwencjonowaliśmy genomy 2636 Islandczyków i znaleźliśmy warianty, które następnie przypisaliśmy genomowi około 398,000 Islandczyków. Zbadaliśmy związek między tymi imputowanymi wariantami a poziomami cholesterolu nie-HDL w 119.146 próbkach. Następnie przeprowadziliśmy testy replikacyjne w dwóch populacjach pochodzenia europejskiego. Oceniliśmy wpływ wariantu utraty funkcji na ryzyko choroby niedokrwiennej serca u 42.524 pacjentów i 249.414 osób z pięciu europejskich populacji pochodzenia. Rozszerzony zestaw genomów badano pod kątem dodatkowych wariantów utraty funkcji w genie docelowym. Oceniliśmy wpływ implikowanego wariantu na stabilność białka. Continue reading “Wariant ASGR1 związany ze zmniejszonym ryzykiem choroby niedokrwiennej serca”

Próba nawadniania ran w początkowym zarządzaniu ran otwartych złamania

Zarządzanie otwartymi złamaniami wymaga irygacji i oczyszczenia ran w celu usunięcia zanieczyszczeń, ale skuteczność różnych ciśnień i rozwiązań do irygacji pozostaje kontrowersyjna. Zbadaliśmy wpływ mydeł kadzielowych w porównaniu z normalnym nawadnianiem solą fizjologiczną uzyskanym przy użyciu wysokiego, niskiego lub bardzo niskiego ciśnienia irygacyjnego. Metody
W tym badaniu, w którym przeprowadzono model czynnikowy 2 na 3, przeprowadzony w 41 ośrodkach klinicznych, losowo przydzielono pacjentów, u których otwarte złamanie kończyn poddawano irygacji za pomocą jednego z trzech ciśnień irygacyjnych (wysokie ciśnienie [> 20 psi], niskie ciśnienie [5 do 10 psi] lub bardzo niskie ciśnienie [1 do 2 psi]) i jeden z dwóch roztworów do irygacji (mydło kauczukowe lub normalny roztwór soli). Pierwszorzędowym punktem końcowym była reoperacja w ciągu 12 miesięcy po chirurgii wskaźnikowej w celu wspomagania gojenia się ran lub kości lub leczenia zakażenia rany.
Wyniki
Łącznie 2551 pacjentów przeszło randomizację, z których 2447 uznano za kwalifikujących się i włączono do ostatecznych analiz. Ponowna operacja wystąpiła u 109 z 826 pacjentów (13,2%) w grupie wysokociśnieniowej, 103 z 809 (12,7%) w grupie niskiego ciśnienia i u 111 z 812 (13,7%) w grupie z bardzo niskim ciśnieniem. Współczynniki zagrożenia dla trzech porównań parami były następujące: dla niskiego do wysokiego ciśnienia 0,92 (95% przedział ufności [CI], 0,70 do 1,20; P = 0,53), dla wysokiego do bardzo niskiego ciśnienia, 1,02 (95% CI, 0,78 do 1,33, P = 0,89), a dla niskiego do bardzo niskiego ciśnienia 0,93 (95% CI, 0,71 do 1,23, P = 0,62). Continue reading “Próba nawadniania ran w początkowym zarządzaniu ran otwartych złamania”